uPath HER2 (4B5) bildanalys för
bröstalgoritmguide
Innehållsförteckning
Inledning 1
Översikt och förklaring av algoritm 2
Avsedd användning 3
Produktens avsedda användning 3
Syftet med algoritmguiden 3
Klinisk signifikans 4
Analysprinciper 5
Begränsningar 6
Nätverksegenskaper 7
Datasäkerhet 8
Arbetsflöde för användningen av uPath HER2 (4B5)-algoritmen 9
Patologarbetsflöde 11
Färgningsegenskaper 18
Utvärdering av antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) 18
Färgningsutvärdering med uPath HER2 (4B5)-algoritmen 18
Prestandaegenskaper 30
Metodjämförelse 30
Patologens reproducerbarhetsstudier 31
Reproducerbarhetsstudier för skanner 32
Felsökning 33
Referenser 37
Inledning
Roche uPath enterprise software (uPath enterprise software)
med uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide (uPath
HER2 (4B5)-algoritm) är ett programvarusystem avsett som
hjälp vid semikvantitativ bedömning av proteinuttryck för human
epidermal tillväxtfaktorreceptor 2 (HER2) i immunohistokemiskt
färgade histologiska sektioner från formalinfixerade,
paraffininbäddade vävnadsprov (FFPE) av normala och
neoplastiska vävnader.
uPath enterprise software är heltäckande programvara för digital
patologi som gör det möjligt för patologilaboratorier att inhämta,
hantera, visa, analysera, dela och rapportera om digitala bilder
av patologiprover. Med uPath enterprise software kan patologen
visa digitala bilder i olika förstoringar, lägga till kommentarer,
göra mätningar av vävnadssektioner, utföra bildanalys och
generera rapporter.
Obs! uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritm är en
kompletterande datorassisterad metodik för att underlätta
inhämtning och mätning av bilder från objektglas för mikroskop
av bröstvävnadsprover som har genomgått immunohistokemisk
färgning för att fastställa förekomst av HER2-protein. För att
säkerställa giltigheten av bildanalysens poäng är det patologens
ansvar att verifiera överensstämmelse och använda lämpliga
kontroller som anges i metodbladet till antikroppen VENTANA
anti-HER2/neu (4B5) (på dialog.roche.com).
1 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Översikt och förklaring av algoritm
För tillämpningar med bildanalys använder patologen uPath
enterprise software för att välja och skissera ett eller flera
intressanta områden (ROI), och varje ROI kan ses med
olika förstoringar och sedan analyseras med uPath HER2
(4B5)-algoritmen. Antalet måltumörceller genereras och
tumörcellerna stratifieras utifrån huruvida de är färgade eller
ofärgade. Färgade celler stratifieras efter färgningsintensitet
och membranfärgningens fullständighet. uPath HER2 (4B5)-
algoritmen kombinerar färgningsprocent (färgad, ofärgad),
färgintensitet (svag, mellan, stark) och färgningens fullständighet
(ofärgad, partiell, fullständig) för att generera en HER2-poäng på
en skala på 0 till 3 +. uPath HER2 (4B5)-algoritmen kan generera
en poäng för ett visst ROI, eller en sammanlagd poäng för alla
utvalda ROI:n på det objektglaset. Patologen kan acceptera
poängen som tillhandahålls av uPath HER2 (4B5)-algoritmen,
eller åsidosätta poängen med en annan poäng. uPath HER2
(4B5)-algoritmen gör inga oberoende tolkningar av data och ska
därför endast användas av en kvalificerad patolog tillsammans
med histologisk undersökning, relevant klinisk information och
korrekt kontroll. uPath HER2 (4B5)-algoritmen är utformad och
indicerad som ett hjälpmedel till patologen för bedömning av
HER2-proteinuttryck i bröstvävnadsprover som färgats med
antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
2 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Produktens avsedda användning
uPath HER2 (4B5)-bildanalys för bröstalgoritmen är avsedd att
användas som ett hjälpmedel för patologen vid semikvantitativ
detektering av HER2-protein i formalinfixerad, paraffininbäddad
neoplastisk bröstvävnad. Vid användning tillsammans med
VENTANA anti-HER2/neu (4B5) Rabbit Monoclonal Primary
Antibody, (antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5)) är
den avsedd att användas som ett hjälpmedel vid bedömning
av bröstcancerpatienter för vilka behandling med Herceptin
®
(trastuzumab), KADCYLA
®
(ado-trastuzumab emtansin) eller
PERJETA
®
(pertuzumab) övervägs.
Obs! uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritm är en
kompletterande datorassisterad metodik för att underlätta
inhämtning och mätning av bilder från objektglas för mikroskop
av bröstvävnadsprover som har genomgått immunohistokemisk
färgning för att fastställa förekomst av HER2-protein. För att
säkerställa giltigheten av bildanalysens poäng är det patologens
ansvar att verifiera överensstämmelse och använda lämpliga
kontroller som anges i metodbladet till antikroppen VENTANA
anti-HER2/neu (4B5).
Denna algoritm är avsedd för in vitro-diagnostisk användning
(IVD).
Avsedd användning
Syftet med algoritmguiden
Denna uPath HER2 (4B5)-algoritmguide (algoritmguiden) är
avsedd att:
• Ge bakgrundsinformation om den avsedda användningen av
uPath HER2 (4B5)-algoritmen, testprinciper och begränsningar.
• Definiera nödvändigt material, IT, datasäkerhet och
nätverkskrav.
• Visa stegvisa anvisningar för att köra uPath HER2 (4B5)-
algoritmen.
• Ge fotografiska bilder som illustrerar hur uPath HER2 (4B5)-
algoritmen ska användas.
• Ge ett verktyg för att underlätta användningen av uPath
HER2 (4B5)-algoritmen på FFPE bröstsektioner färgade med
antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
• Ge exempelbilder av utmanande fall för att ge vägledning om hur
uPath HER2 (4B5)-algoritmen ska användas vid utvärdering.
• Visa prestandaegenskaperna för uPath HER2 (4B5)-algoritmen.
3 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Klinisk signifikans
Bröstcancer är det vanligaste karcinomet hos kvinnor och
den näst vanligaste cancerrelaterade dödsorsaken.
1,2
I
Nordamerika är risken för att en kvinna ska få bröstcancer en
på åtta.
1
Tidig upptäckt och lämplig behandling kan påverka
den allmänna överlevnaden betydligt.
3,4
Små vävnadsprover
kan enkelt användas vid rutinmässig immunohistokemi (IHC),
vilket gör att denna teknik, i kombination med antikroppar som
detekterar antigener som är viktiga för tolkning av karcinom,
utgör ett effektivt verktyg för patologen vid diagnos och
prognos av sjukdomen. En viktig markör i bröstcancer idag är
onkoproteinet HER2.
5,6,7,8
De terapeutiska läkemedlen Herceptin
(trastuzumab), KADCYLA (ado-trastuzumab emtansine) och
PERJETA (pertuzumab), har visat sig gynna vissa patienter med
bröstkarcinom genom att bromsa, och i vissa fall tillbakabilda
cancerns tillväxt.
5,6,7,8,9
Läkemedlen är humaniserade
monoklonala antikroppar som binder till HER2-proteinet i
cancerceller.
5,8,9,10
In vitro-diagnostik för utvärdering av HER2-status hos
bröstcancerpatienter är viktigt för att hjälpa klinikern att
fastställa HER2-inriktad behandling.
5,6,7,8
Antikroppen
VENTANA anti-HER2/neu (4B5) är avsedd att användas vid IHC-
baserad detektering av HER2-proteinuttryck vid bröstcancer.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen fungerar som ett tillbehör till
antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) vid bedömning
av bröstcancerpatienter för vilka behandling med Herceptin
(trastuzumab), KADCYLA (ado-trastuzumab emtansine) eller
PERJETA (pertuzumab) övervägs.
4 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Analysprinciper
Kriterier för intensitet och mönster för cellmembranfärgning
för poängen från uPath HER2 (4B5)-algoritmen:
Färgningsmönster Poäng HER2-färgningsbedömning
Ingen membranfärgning
observerad
0 Negativt
Svag, partiell färgning av
membranet i någon del
av cancercellerna
1+ Negativt
Svag till måttlig
fullständig färgning av
membranet, > 10% av
cancercellerna
2+ Tvetydig*
Intensiv, komplett
färgning av membranet,
> 10% av cancercellerna
3+ Positiv
* Rekommendera reflex till ISH
uPath enterprise software med uPath HER2 (4B5)-algoritmen
använder bildanalystekniker för att erhålla en HER2-poäng.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen använder fördefinierade
parametrar för att poängsätta bilder av vävnad som färgats med
antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
Steg involverade i bildanalys:
• Upptäckt av celler över hela bilden.
• Klassificering av celler som tumörceller eller andra celltyper.
• Identifiering av färgat membran och stratifiering av membran
i kategorier: partiell eller fullständig färgning och svag, mellan
eller stark färgning.
• Beräkning av HER2-poängen genom att kombinera
cellklassificering, färgintensitet och membranklassificering.
Hur HER2-bildanalysalgoritmen identifierar tumörceller
och hur poängen beräknas:
• uPath HER2 (4B5)-algoritmen identifierar tumörceller med hjälp
av färg, intensitet, storlek och morfologiska egenskaper.
• Identifierade tumörceller klassificeras som färgade med hjälp av
detekterade membran och förinställda tröskelvärden.
• För att beräkna HER2-poängen använder uPath HER2 (4B5)-
algoritmen de identifierade färgade cellerna och stratifierar dem
efter färgningsintensitet och fullständighet.
5 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
uPath HER2 (4B5)-algoritmen är utformad för att fungera
tillsammans med antikroppen VENTANA anti-HER2/neu
(4B5). Testresultaten är endast så goda som kvaliteten och
noggrannheten på det IHC-objektglas som avbildas och den
efterföljande bilden som analyseras.
Patologen måste validera den VENTANA anti-HER2/neu (4B5)-
antikroppsfärgning som utförs genom manuell mikroskopisk
undersökning av HER2-kontrollglasen för att verifiera att de
förväntade resultaten har uppnåtts innan bilder av objektglas
ansluts till uPath enterprise software för analys.
Tillverkarens rekommendationer för antikroppen VENTANA
anti-HER2/neu (4B5) måste följas, inklusive användning
av allt material för positiv och negativ kontroll för varje
färgningskörning. Om kontrollglasen inte är acceptabla vid
manuell mikroskopisk undersökning måste vävnaden färgas igen
med acceptabla resultat.
Patologen måste följa rekommendationerna för VENTANA anti-
HER2/neu (4B5)-antikroppstolkning.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen är utformad för att användas av
en kvalificerad patolog tillsammans med histologisk relevant
undersökning, klinisk information och korrekt kontroll. Den
är inte utformad för att vara ett fristående verktyg och kräver
kompetent mänskligt ingripande under hela analysprocessen.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen kan generera felaktiga poäng
om de tagna bilderna har onormal färgning (kärnfärgning,
pigmentering, etc.).
uPath HER2 (4B5)-algoritmen kan avvisa tumörkärnor som är
långsträckta oavsett vilken cellens övergripande form är. Därför
kan tumörer som innehåller ett stort antal celler med avlånga
tumörkärnor behöva bedömas manuellt.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen har tränats, utvecklats och
validerats på: invasiva lobulära, duktala, mucinösa, medullära,
papillära och mikropapillära karcinom samt några fall av
metastatiska lesioner.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen har inte testats, eller så har inte
dess säkerhet och effektivitet validerats, när den används med
en persondator (PC) hemifrån.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen identifierar DAB-färgade
membran av samtliga intensiteter och fullständighetsgrader.
Den använder ett bruströskelvärde på 0,5% av alla tumörceller
för att poängsätta ett fall som 1+. Den följer inte metodbladets
riktlinjer för användning av en encellströskel för en poäng på
1+. Detta kan i vissa fall resultera i att mycket få celler som
har membranfärgning får 0 i stället för 1+. Denna bruströskel
implementerades för att säkerställa att verkliga negativa fall
anges med 0.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen är utformad för att vara känslig
för färgen brunt (DAB-färgning) för att säkerställa att även
svag membranfärgning upptäcks. Av denna anledning kan
den felaktigt poängsätta ett vävnadsprov som innehåller bruna
artefakter som pigmentering, bakgrundsfärgning i muskelfibrer
eller andra artefakter som har färgats bruna. Det finns verktyg i
uPath enterprise software som gör det möjligt för patologen att
utesluta sådana områden. Dessa diskuteras närmare i avsnittet
om färgningsegenskaper.
uPath HER2 (4B5)-algoritmen är utformad för att vara känslig
för 2+-fall. Därför kan uPath HER2 (4B5)-algoritmen felaktigt
poängsätta vissa 1+-fall som 2+. Närmare bestämt kan 1+-
fall med något mindre än 10% av tumörcellerna med komplett
färgning eller fall med en hög andel cytoplasmisk färgning i
tumörceller få den felaktiga poängen 2+. Patologen kan behöva
åsidosätta poängen i dessa särskilda fall. Cytoplasmisk färgning
diskuteras närmare i avsnittet om färgningsegenskaper.
Begränsningar
6 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
7 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Nätverksegenskaper
En 1Gbps nätverksanslutning mellan uPath enterprise software och bildhanteringssystemet (IMS) rekommenderas.
Tabell 1. Specifikationer för Roche uPath bildanalysserver för små laboratorier.
Parameter Detaljer
Processor CPU @ 3,6 GHz
Antal kärnor 4
RAM 6 x 8GB (48 GB)
Flertrådsteknik Deaktiverad
Hårddisk 240 GB SSD
Operativsystem Microsoft Windows Server 2016
Stöd för virtuell dator (VM) Ja
Ytterligare information om VM Prestanda kommer att skilja sig från de fysiska servrarna på grund av den virtuella datorns
omkostnader.
Antivirus Symantec Endpoint Protection Version 12
Effekt 110V/220V, 800Watt (2)
Portar 2 USB, HPE Eth 10/25Gb-adapter
Avbrottsfri strömkälla Rekommenderas
Tabell 2. Specifikationer för Roche uPath bildanalysserver för mellanstora till stora laboratorier.
Parameter Detaljer
Processor CPU @ 3,6 GHz (2 processorer)
Antal kärnor 8 per processor/16 totalt
RAM 12 x 8GB (96 GB)
Flertrådsteknik Deaktiverad
Hårddisk 240 GB SSD (2x)
Operativsystem Microsoft Windows Server 2016
Stöd för virtuell dator (VM) Ja
Ytterligare information om VM Prestanda kommer att skilja sig från de fysiska servrarna på grund av den virtuella datorns
omkostnader.
Antivirus Symantec Endpoint Protection Version 12
Effekt 110V/220V, 800Watt (2)
Portar 2 USB, HPE Eth 10/25Gb-adapter
Avbrottsfri strömkälla Rekommenderas
Skadlig programvara eller icke-auktoriserad åtkomst till
instrumentet kan leda till förlust av data eller driftavbrott på
instrumentet.
Följande rekommendationer är viktiga för att undvika infektion
med skadlig programvara eller obehörig åtkomst och missbruk
av instrumentet:
• Installera inte och kör inte någon annan programvara på
instrumentet.
• Kontrollera att andra datorer och tjänster på nätverket
är korrekt säkrade och skyddade mot skadlig
programvara och icke-auktoriserad åtkomst. Till exempel
laboratorieinformationssystemet (LIS), delad arkivering, delad
säkerhetskopiering eller service.
• Kunderna är ansvariga för säkerheten i deras lokala nätverk,
särskilt för att skydda det mot skadlig programvara och attacker.
Detta skydd kan inkludera åtgärder som en brandvägg, för att
skilja enheten från okontrollerade nätverk. Skyddet kan också
inkludera åtgärder som garanterar att det anslutna nätverket är
fritt från skadlig kod.
• Begränsa fysisk åtkomst till instrumentet och all ansluten IT-
infrastruktur (datorer, kablar, nätverksutrustning osv.).
• Se till att instrumentets säkerhetskopior och arkivfiler är
skyddade från obehörig åtkomst och haveri. Denna lista
innefattar fjärrlagringsplats, webbplatser för haveriåterställning
och säker överföring av säkerhetskopior.
• Använd en brandvägg om möjligt, för att begränsa
nätverkstrafiken.
• USB-minnen kan användas för flera typer av säkerhetskopior
och återställningar. Felaktig hantering av ett USB-minne kan
leda till dataförlust eller fel på instrumentet.
• Använd endast USB-minnen som testas och installeras av din
lokala Roche-servicerepresentant.
• Endast en USB-enhet kan användas åt gången. Innan du sätter
i ett USB-minne ska du kontrollera att ingen annan USB-enhet
är insatt.
• Innan du tar bort ett USB-minne ska du klicka på knappen Eject
(Mata ut) i Windows.
• Standardinställningen för operativsystem (OS) som medföljer
servern bör inte ändras eftersom det påverkar de inställda OS-
konfigurationerna.
• Använd USB-flashenheten uteslutande på instrumentet för
att förhindra att ett virus infekterar uPath enterprise software.
Förvara inte andra data på detta USB-minne.
Datasäkerhet
8 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Arbetsflöde för användningen av uPath HER2 (4B5)-algoritmen
Medföljande material
• uPath HER2 (4B5)-algoritm
Material som behövs men inte medföljer
• uPath enterprise software
• Objektglas med bröstvävnad som färgats med antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5), med hjälp av ultraView Universal DAB
Detection Kit, färgade på ett BenchMark ULTRA-instrument.
• VENTANA DP 200 objektglasskanner
Varningar och försiktighetsåtgärder
1. För in vitro-diagnostisk användning (IVD).
2. Endast för yrkesmässigt bruk.
3. VAR FÖRSIKTIG: Enligt federal lag i USA får enheten endast säljas av läkare, eller enligt läkares ordination. (Rx Only)
4. För att rapportera misstänkta allvarliga händelser relaterade till denna enhet, kontakta den lokala Roche-representanten och behörig
myndighet i den medlemsstat eller det land där användaren är etablerad.
Arbetsflöde
1. Bröstvävnaden på ett objektglas färgas med antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) med hjälp av ett BenchMark ULTRA-
instrument.
2. Bildförvärv (hel objektglasskanning) utförs med VENTANA DP 200 objektglasskannern med 20x förstoring i ett z-plan.
3. När digitala bilder har inhämtats överförs dessa bilder från datorn som är associerad med VENTANA DP 200 objektglasskannern till
bildhanteringssystemet (IMS) på en centraliserad server.
4. Efter överföring till servern skapas ett fall i uPath enterprise software. Skapande av fall kan ske automatiskt genom kommunikation
med laboratorieinformationssystemet (LIS) med identifieringsinformation (d.v.s vävnadstyp och primär antikropp) som finns i
streckkodsetiketten på objektglaset eller matas in manuellt i uPath enterprise software. Se användarhandbok för uPath enterprise
software (PN 1018943SV).
5. Om uPath HER2 (4B5)-algoritmen är installerad (måste installeras på en separat server från uPath enterprise software och IMS) och
en 20x-bild inhämtas med lämplig färg och vävnadstyp utlöser sedan uPath enterprise software automatiskt en helbildsanalys (WSA).
6. WSA analyserar automatiskt hela den skannade bilden.
7. När WSA är klar visas ett blått fält med meddelandet ”analysis successful” (Analysen lyckades) för patologen i uPath enterprise
software.
8. Patologen kan välja specifika ROI:n att poängsätta med hjälp av ROI- och Exclusion-verktygen i uPath enterprise software.
9. Patologen granskar resultaten av bildanalysen och antingen accepterar poängen eller åsidosätter den manuellt.
Färgning
• Vävnadsberedning och färgning ska följa rekommendationerna i metodbladet för antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
• Alla korrekta kontroller ska granskas och objektglasen ska färgas om ifall färgningen inte uppfyller riktlinjerna i metodbladet för
antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
• uPath HER2 (4B5)-algoritmen kräver att antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) används och allt ytterligare material och alla
tillbehör som anges i metodbladet för antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) för att färga vävnader före analys.
9 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
• Antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) detekterar HER2-protein i FFPE-bröstvävnad som färgats med ultraView Universal DAB
Detection Kit på ett BenchMark ULTRA-instrument.
Bildtagning
En VENTANA DP 200 objektglasskanner krävs för att skanna objektglasen. Bilderna måste skannas med 20x förstoring. Det
rekommenderas att vävnaden är fri från veck och bläck. Om stora delar av bilden är ur fokus rekommenderas det att objektglasen skannas
in igen. Ytterligare information om skanning finns i användarhandboken till VENTANA DP 200 objektglasskanner IVD (PN 1017149SV).
Allmän navigering: uPath enterprise software
uPath enterprise software är avsedd att anpassas efter individuella behov och lokala behov inklusive, men inte begränsat till
rapportkonfiguration och användargränssnitt. Denna algoritmguide fokuserar endast på de verktyg som krävs för att använda uPath
HER2 (4B5)-algoritmen. Ytterligare information om uPath enterprise software finns i användarhandboken för uPath enterprise software.
10 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Patologarbetsflöde
Öppna ett fall i uPath Enterprise Software
För att komma åt bilder av bröstvävnad som färgats med antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) dubbelklickar du på ett fall eller
väljer ett fall på fliken Viewer (Visning) (Bild 1).
En skärm med alla bilder associerade med ett fall kommer att visas (Bild 2).
Bild 2
Bild 1
11 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
När ett objektglas som är färgat med antikroppen VENTANA anti-HER2/neu (4B5) skannas på en VENTANA DP 200 objektglasskanner
vid 20x importeras bilden till uPath enterprise software och associeras med ett fall. uPath HER2 (4B5)-algoritmen utlöser automatiskt
en WSA. Tider då WSA-förberäkningssteget ska slutföras beror på serverspecifikationer, bildstorlekar och antal bilder i kön. När
meddelandet ”waiting to start auto-analysis” (Väntar på att starta automatisk analys) visas anger det att bilderna står i kö och ännu
inte har analyserats och meddelandet ”analyzing” (Analyserar) används när WSA utförs (Bild 3 och 4).
När bilden har analyserats fullständigt via WSA i uPath enterprise software, kommer meddelandet ”analysis successful” (Analys slutförd)
att visas under objektglaset i Viewer (Visning) (Bild 5). Bilder kan inte poängsättas innan WSA har slutförts.
Bild 5
Bild 4
Bild 3
12 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Rita ROI(er) för hel tumör: Välja tumörområde
Använd verktygsknappen Freehand (Frihand) i rullgardinsmenyn för ROI (Bild 6) för att välja tumörområde(n) på den IHC-bildskärmbild
som ska analyseras. Bild 7 illustrerar en bild som har en enda ROI ritad. Ytterligare ROI:er kan ritas. Varje område som väljs visar en ROI i
Slide Panel (Bildpanelen) (Bild 8).
Bild 7
Bild 8
Bild 6
13 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Rita ROI(er) för hel tumör: Exkluderingsområde
När ROI:er ritas kan vissa områden exkluderas. Specifika områden som ska undvikas eller utelämnas samt exempel behandlas i avsnittet
om färgningsegenskaper nedan. Använd exkluderingsverktyget Freehand (Frihand) i rullgardinsmenyn Exclusion (Exkludering) (Bild 9)
för att exkludera specifika områden (Bild 10). Om stora delar av bilden är suddiga eller ur fokus ska du skanna objektglaset igen.
Exkluderade områden analyseras inte av uPath HER2 (4B5)-algoritmen, och de färgade och ofärgade tumörcellerna i detta område
exkluderas från det totala analysområdet. Om ROI:n redan har analyserats och en exkludering används, måste ROI:n analyseras igen
och överläggningen samt poängen uppdateras därefter.
Det kan vara mycket tidskrävande att rita ett stort antal exkluderingar, särskilt komplicerade exkluderingar med verktyget Freehand
(Frihand) och det kan påverka effektiviteten i arbetsflödet samtidigt som det endast har en marginell påverkan på slutpoängen. Om ett
fall kräver ett stort antal exkluderingar ska patologen:
• Rita flera ROI:er och exkludera delar av vävnad som han eller hon inte anser kan poängsättas med minimal användning av verktyget
Exclusion (Exkludering).
• Begränsa exkluderingar och åsidosätta poängen manuellt med en annan poäng.
Rita ROI(er) för hel tumör: Radering
Om ett valt ROI för hel tumör inte är optimalt kan det raderas. Välj ROI för hel tumör genom att klicka på mitten av ROI:n på bilden
och sedan klicka på knappen Delete (Radera) i Slide Panel (Bildpanelen) (Bild 11) eller i objektglaset nära ROI (Bild 12). Ett
bekräftelsefönster visas. Välj Confirm (Bekräfta) för att radera vald ROI. Välj Cancel (Avbryt) för att behålla ROI.
Bild 9
Bild 11
Bild 12
Bild 10
14 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
När alla ROI(er) för hel tumör och/eller exkluderingsområden har ritats är bilden redo att analyseras. Välj hela tumörens ROI genom att
klicka på mitten av ROI som ska analyseras eller klicka på ROI i Slide Panel (Bildpanelen). För varje ROI trycker du på knappen Image
Analysis (Bildanalys) antingen på Slide Panel (Bildpanelen) (Bild 13) eller bredvid ROI (Bild 14).
När HER2-analysen är klar visas resultaten i Slide Panel (Bildpanelen) på två platser: under Slide Score (Poäng för objektglas) och
bredvid ROI:er (Bild 15). Slide Score (Poäng för objektglas) baseras på en sammanfattning av HER 2-statusen för alla utvalda ROI(er),
vilket är den poäng som kommer att visas i rapporten.
Du kan också se mer detaljerad information i panelen för Slide Score (Poäng för objektglas) och ROI details (ROI-detaljer) genom att
klicka på panelikonen (Bild 16). Panelen för Slide Score (Poäng för objektglas) visas (Bild 17). Om du klickar på samma panelikon igen
döljs också denna information.
Bild 15
Bild 17
Bild 16
Bild 13
Bild 14
15 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
HER2-bildanalys: Färgöverlagring
När du trycker på knappen ROI(s) Analysis (Analys av ROI(er)) och vävnaden analyserats, kommer en färgöverlagring att visas på
ROI:t. På bilden nedan (Bild 18) representerar den röda överlagringen cellmembran som fastställts vara positivt färgade för HER2.
När du tar tag i bilden (vänsterklicka med musen och flytta bilden) försvinner överlagringen (Bild 19). När musknappen släpps, visas
överlagringen igen (Bild 18).
Bild 18
Bild 19
16 uPath HER2 (4B5) bildanalys för bröstalgoritmguide
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
Sidan laddas ...
-
1
-
2
-
3
-
4
-
5
-
6
-
7
-
8
-
9
-
10
-
11
-
12
-
13
-
14
-
15
-
16
-
17
-
18
-
19
-
20
-
21
-
22
-
23
-
24
-
25
-
26
-
27
-
28
-
29
-
30
-
31
-
32
-
33
-
34
-
35
-
36
-
37
-
38
-
39
-
40
-
41
-
42
Relaterade papper
-
Roche uPath IVD Användarmanual
-
Roche BenchMark ULTRA Användarmanual
-
Roche BenchMark XT/LT Användarmanual
-
Roche uPath PD-L1 image analysis for NSCLC IVD Algorithm Användarmanual
-
-
-
-
-
Roche BenchMark GX Användarmanual
-
